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          【新疆日報】全球首個(gè)!新疆生地所搭建耐脫水植物基因組數據庫

          時(shí)間:2024-01-08

            石榴云/新疆日報訊(記者 謝慧變報道)記者從中國科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所獲悉:新疆生地所在干旱區生物種質(zhì)資源收集和保育平臺建設方面取得重要進(jìn)展,已搭建全球首個(gè)耐脫水植物基因組數據庫,為我國干旱區生物多樣性保育和可持續利用提供了重要科技支撐。這是新疆生地所5日發(fā)布的2023年重要科技進(jìn)展之一。

            耐脫水植物基因組數據庫包含26套營(yíng)養體耐脫水相關(guān)植物基因組數據資源,其中10套為苔蘚植物的基因組。

          這個(gè)叫齒肋赤蘚,拉丁名Syntrichia caninervis,從左到右分別為,古爾班通古特沙漠生物結皮、干燥脫水狀態(tài)的苔蘚、復水3-5秒后的苔蘚。

          (中國科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所高貝 供圖)

            記者了解到,耐脫水被認為是陸地植物中一種古老且極為罕見(jiàn)的性狀,主要存在于種子和孢子等繁殖體中。耐脫水植物具有“干而不死,遇水復蘇”的典型特征,被認為是植物界中的“三體人”。

            耐干苔蘚就是耐脫水植物的一種。耐干苔蘚廣泛分布在古爾班通古特沙漠,覆蓋在沙子表面,被譽(yù)為“沙漠地毯”,遇水后能在3秒內迅速變綠,對維持沙漠穩定性有很好的作用。

            新疆生地所研究員張道遠團隊研究發(fā)現,沙漠極端的環(huán)境造就了耐干苔蘚超強的耐干燥、耐高溫等綜合抗逆性,也成為挖掘抗逆基因的好材料。

            新疆生地所副研究員高貝介紹,過(guò)去十年里,測序技術(shù)的進(jìn)步與普及應用使我們有機會(huì )更深入地研究這類(lèi)耐脫水植物的基因組及其演化特征。然而,尚未有一個(gè)專(zhuān)門(mén)的綜合數據庫來(lái)整合這些寶貴的基因組資源。

            新疆生地所研究員張道遠團隊基于對脫水植物基因組學(xué)研究多年的積累,搭建的全球首個(gè)耐脫水植物基因組數據庫,整合了豐富的生物信息學(xué)分析工具模塊,如多種類(lèi)型的序列比對、同源基因簇搜索、功能檢索等,為相關(guān)研究人員對該類(lèi)植物的基因數據資源整合,發(fā)掘和利用提供了參考。

            干旱區具有豐富的抗干旱、高溫、鹽堿等逆境的生物種質(zhì)資源,建設干旱區生物種質(zhì)資源庫,對種質(zhì)資源的收集保育、研究及開(kāi)發(fā)利用至關(guān)重要。

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